怀疑为龟头炎的患者可刮取阴茎龟头、冠状沟或包皮处皮损表面鳞屑作为待检标本。
将待检标本用10%氢氧化钾或生理盐水制片，镜下可见成群的卵圆形孢子和假菌丝，如找到较多的假菌丝时，说明念珠菌处于致病阶段。
该病也可用革兰染色法，刚果红染色或PAS染色法染色后镜检，其阳性率均比直接镜检法高。
判断依据：革兰染色，孢子和假菌丝染成兰色：刚果红和PAS染色，孢子和假菌丝则染成红色。
念珠菌性龟头炎(包皮炎)可在病变的龟头、包皮上取材镜检或培养可找到念珠菌。
滴虫性龟头炎可在分泌物上找到滴虫。
涂片检查阴性的患者，可进行念珠菌培养。
在无菌条件下将受检标本接种于沙氏培养基上，接种时将试管培养基斜而割破少许，每管接种2-3处，每份标本接种2管。将培养基放入37℃温箱内孵育24-48小时后观察，可见大量乳白色菌落生长，用接种针挑取少量菌落涂片，直接镜检或染色后镜检，可见大量芽孢子，可初步诊断为念珠菌感染。
